La Universidad Nacional de San Martín, Pionera Casa Superior de Estudios en la Región San Martín, fue creada por Decreto Ley Nº 22803 el 18 de diciembre de 1979, en el gobierno del Presidente de la República, General de División Ejército Peruano Francisco Morales Bermúdez Cerruti, como consecuencia de la lucha del pueblo sanmartinense, por obtener una institución educativa con nivel universitario en la región.

El 16 de diciembre de 1980, con Resolución N° 756-80-CONAI del Consejo Nacional Interuniversitario se nombra la primera la Comisión de Gobierno de la Universidad Nacional de San Martín, presidida por el Ing. Raúl Ríos Reátegui, como miembros el Prof. Dalín Omar Encomenderos Dávalos y el Blgo. Raúl Espíritu Cavero.

El 26 de enero de 1981 se declara a la ciudad de Tarapoto como sede de la Universidad Nacional de San Martín, con Resolución N° 905-81-CONAI de la Comisión Nacional Interuniversitaria, se acuerda que la ciudad de Tarapoto, reúne los requisitos necesarios para ser designada como sede de la Universidad, estando a lo acordado en sesión del día 20 de enero de 1981 con Decreto Ley N° 22803, se ratifica la creación de la Universidad con Ley N° 23261 el 18 de julio de 1981.

Con fecha 09 de noviembre de 1981 se formó la primera Comisión Central de Admisión con Resolución N° 148-81-CG-UNSM, que inicia sus labores académicas y administrativas a partir del 09 de 0ctubre hasta al 24 de noviembre y fue integrada por los siguientes docentes de la Universidad Nacional de Ingeniería: Ing. Luz Espinoza Canales como Presidente, y como miembros el Dr. Humberto Asmat Azahuanche y Lic. Mauro Chumpitaz Reyna.

El 20 de octubre del 2004, con Resolución N° 005-2004-UNSM/AU-R de la Asamblea Universitaria aprueba el proyecto de creación de la Escuela de Posgrado de la Universidad Nacional de San Martín, presidida por el Dr. Jorge Sandoval Rojas, como miembros el ing. Dr. Jaime Walter Alvarado Ramírez y el Prof.Mg. juan Julio León Montalvo